Protein–RNA interactions for Protein: E9PGA6

C1QTNF3-AMACR, C1QTNF3-AMACR readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms