Protein–RNA interactions for Protein: A6NKC0

FAM90A7P, Putative protein FAM90A7P, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM90A7PA6NKC0 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM90A7PA6NKC0 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM90A7PA6NKC0 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM90A7PA6NKC0 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM90A7PA6NKC0 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM90A7PA6NKC0 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM90A7PA6NKC0 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM90A7PA6NKC0 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM90A7PA6NKC0 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM90A7PA6NKC0 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM90A7PA6NKC0 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM90A7PA6NKC0 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM90A7PA6NKC0 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM90A7PA6NKC0 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM90A7PA6NKC0 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM90A7PA6NKC0 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM90A7PA6NKC0 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM90A7PA6NKC0 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM90A7PA6NKC0 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM90A7PA6NKC0 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM90A7PA6NKC0 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM90A7PA6NKC0 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM90A7PA6NKC0 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM90A7PA6NKC0 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM90A7PA6NKC0 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM90A7PA6NKC0 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM90A7PA6NKC0 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM90A7PA6NKC0 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM90A7PA6NKC0 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM90A7PA6NKC0 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM90A7PA6NKC0 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM90A7PA6NKC0 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM90A7PA6NKC0 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM90A7PA6NKC0 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM90A7PA6NKC0 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM90A7PA6NKC0 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM90A7PA6NKC0 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM90A7PA6NKC0 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM90A7PA6NKC0 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM90A7PA6NKC0 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM90A7PA6NKC0 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM90A7PA6NKC0 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM90A7PA6NKC0 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM90A7PA6NKC0 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM90A7PA6NKC0 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM90A7PA6NKC0 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM90A7PA6NKC0 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM90A7PA6NKC0 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM90A7PA6NKC0 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM90A7PA6NKC0 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM90A7PA6NKC0 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM90A7PA6NKC0 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM90A7PA6NKC0 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM90A7PA6NKC0 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM90A7PA6NKC0 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM90A7PA6NKC0 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM90A7PA6NKC0 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM90A7PA6NKC0 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM90A7PA6NKC0 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM90A7PA6NKC0 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM90A7PA6NKC0 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM90A7PA6NKC0 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM90A7PA6NKC0 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM90A7PA6NKC0 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM90A7PA6NKC0 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM90A7PA6NKC0 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM90A7PA6NKC0 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM90A7PA6NKC0 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM90A7PA6NKC0 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM90A7PA6NKC0 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM90A7PA6NKC0 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM90A7PA6NKC0 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM90A7PA6NKC0 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM90A7PA6NKC0 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM90A7PA6NKC0 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM90A7PA6NKC0 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM90A7PA6NKC0 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM90A7PA6NKC0 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM90A7PA6NKC0 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM90A7PA6NKC0 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM90A7PA6NKC0 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM90A7PA6NKC0 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM90A7PA6NKC0 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM90A7PA6NKC0 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM90A7PA6NKC0 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM90A7PA6NKC0 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM90A7PA6NKC0 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM90A7PA6NKC0 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM90A7PA6NKC0 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM90A7PA6NKC0 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM90A7PA6NKC0 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM90A7PA6NKC0 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM90A7PA6NKC0 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM90A7PA6NKC0 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM90A7PA6NKC0 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM90A7PA6NKC0 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM90A7PA6NKC0 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM90A7PA6NKC0 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM90A7PA6NKC0 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM90A7PA6NKC0 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms