Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms