Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VWA8A3KMH1 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VWA8A3KMH1 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
VWA8A3KMH1 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
VWA8A3KMH1 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
VWA8A3KMH1 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
VWA8A3KMH1 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
VWA8A3KMH1 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VWA8A3KMH1 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VWA8A3KMH1 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VWA8A3KMH1 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
VWA8A3KMH1 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VWA8A3KMH1 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VWA8A3KMH1 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VWA8A3KMH1 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VWA8A3KMH1 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VWA8A3KMH1 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VWA8A3KMH1 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VWA8A3KMH1 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VWA8A3KMH1 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VWA8A3KMH1 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VWA8A3KMH1 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
VWA8A3KMH1 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VWA8A3KMH1 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VWA8A3KMH1 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VWA8A3KMH1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VWA8A3KMH1 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VWA8A3KMH1 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VWA8A3KMH1 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VWA8A3KMH1 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VWA8A3KMH1 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VWA8A3KMH1 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
VWA8A3KMH1 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VWA8A3KMH1 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VWA8A3KMH1 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VWA8A3KMH1 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VWA8A3KMH1 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VWA8A3KMH1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VWA8A3KMH1 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VWA8A3KMH1 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VWA8A3KMH1 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
VWA8A3KMH1 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VWA8A3KMH1 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VWA8A3KMH1 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VWA8A3KMH1 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VWA8A3KMH1 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VWA8A3KMH1 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VWA8A3KMH1 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VWA8A3KMH1 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
VWA8A3KMH1 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
VWA8A3KMH1 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VWA8A3KMH1 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
VWA8A3KMH1 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
VWA8A3KMH1 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
VWA8A3KMH1 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VWA8A3KMH1 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VWA8A3KMH1 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VWA8A3KMH1 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VWA8A3KMH1 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VWA8A3KMH1 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VWA8A3KMH1 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VWA8A3KMH1 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VWA8A3KMH1 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
VWA8A3KMH1 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VWA8A3KMH1 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VWA8A3KMH1 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VWA8A3KMH1 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VWA8A3KMH1 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VWA8A3KMH1 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VWA8A3KMH1 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VWA8A3KMH1 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VWA8A3KMH1 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VWA8A3KMH1 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VWA8A3KMH1 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
VWA8A3KMH1 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VWA8A3KMH1 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VWA8A3KMH1 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VWA8A3KMH1 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VWA8A3KMH1 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VWA8A3KMH1 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VWA8A3KMH1 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VWA8A3KMH1 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VWA8A3KMH1 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VWA8A3KMH1 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VWA8A3KMH1 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VWA8A3KMH1 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VWA8A3KMH1 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VWA8A3KMH1 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VWA8A3KMH1 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VWA8A3KMH1 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VWA8A3KMH1 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VWA8A3KMH1 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VWA8A3KMH1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VWA8A3KMH1 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VWA8A3KMH1 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VWA8A3KMH1 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VWA8A3KMH1 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VWA8A3KMH1 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
VWA8A3KMH1 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
VWA8A3KMH1 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms