Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJW0

DCTN4, Dynactin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN4Q9UJW0 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DCTN4Q9UJW0 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DCTN4Q9UJW0 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DCTN4Q9UJW0 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DCTN4Q9UJW0 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DCTN4Q9UJW0 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DCTN4Q9UJW0 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DCTN4Q9UJW0 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
DCTN4Q9UJW0 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DCTN4Q9UJW0 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DCTN4Q9UJW0 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DCTN4Q9UJW0 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DCTN4Q9UJW0 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DCTN4Q9UJW0 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
DCTN4Q9UJW0 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
DCTN4Q9UJW0 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
DCTN4Q9UJW0 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
DCTN4Q9UJW0 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DCTN4Q9UJW0 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DCTN4Q9UJW0 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DCTN4Q9UJW0 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DCTN4Q9UJW0 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DCTN4Q9UJW0 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DCTN4Q9UJW0 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DCTN4Q9UJW0 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DCTN4Q9UJW0 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DCTN4Q9UJW0 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DCTN4Q9UJW0 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DCTN4Q9UJW0 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DCTN4Q9UJW0 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
DCTN4Q9UJW0 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
DCTN4Q9UJW0 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DCTN4Q9UJW0 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DCTN4Q9UJW0 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DCTN4Q9UJW0 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DCTN4Q9UJW0 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DCTN4Q9UJW0 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DCTN4Q9UJW0 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DCTN4Q9UJW0 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DCTN4Q9UJW0 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DCTN4Q9UJW0 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DCTN4Q9UJW0 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DCTN4Q9UJW0 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DCTN4Q9UJW0 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DCTN4Q9UJW0 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DCTN4Q9UJW0 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DCTN4Q9UJW0 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DCTN4Q9UJW0 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
DCTN4Q9UJW0 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DCTN4Q9UJW0 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DCTN4Q9UJW0 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DCTN4Q9UJW0 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DCTN4Q9UJW0 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DCTN4Q9UJW0 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DCTN4Q9UJW0 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DCTN4Q9UJW0 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DCTN4Q9UJW0 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DCTN4Q9UJW0 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
DCTN4Q9UJW0 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DCTN4Q9UJW0 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DCTN4Q9UJW0 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DCTN4Q9UJW0 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DCTN4Q9UJW0 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DCTN4Q9UJW0 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DCTN4Q9UJW0 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DCTN4Q9UJW0 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
DCTN4Q9UJW0 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DCTN4Q9UJW0 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DCTN4Q9UJW0 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DCTN4Q9UJW0 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DCTN4Q9UJW0 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DCTN4Q9UJW0 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DCTN4Q9UJW0 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DCTN4Q9UJW0 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DCTN4Q9UJW0 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DCTN4Q9UJW0 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DCTN4Q9UJW0 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DCTN4Q9UJW0 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DCTN4Q9UJW0 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DCTN4Q9UJW0 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DCTN4Q9UJW0 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DCTN4Q9UJW0 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DCTN4Q9UJW0 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DCTN4Q9UJW0 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DCTN4Q9UJW0 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DCTN4Q9UJW0 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DCTN4Q9UJW0 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
DCTN4Q9UJW0 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DCTN4Q9UJW0 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DCTN4Q9UJW0 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
DCTN4Q9UJW0 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DCTN4Q9UJW0 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DCTN4Q9UJW0 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DCTN4Q9UJW0 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DCTN4Q9UJW0 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DCTN4Q9UJW0 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DCTN4Q9UJW0 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DCTN4Q9UJW0 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DCTN4Q9UJW0 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DCTN4Q9UJW0 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms