Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms