Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZZ3

CHMP5, Charged multivesicular body protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP5Q9NZZ3 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms