Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZCCHC17Q9NP64 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZCCHC17Q9NP64 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZCCHC17Q9NP64 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZCCHC17Q9NP64 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZCCHC17Q9NP64 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ZCCHC17Q9NP64 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZCCHC17Q9NP64 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZCCHC17Q9NP64 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZCCHC17Q9NP64 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ZCCHC17Q9NP64 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZCCHC17Q9NP64 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZCCHC17Q9NP64 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZCCHC17Q9NP64 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZCCHC17Q9NP64 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZCCHC17Q9NP64 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZCCHC17Q9NP64 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZCCHC17Q9NP64 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZCCHC17Q9NP64 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZCCHC17Q9NP64 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZCCHC17Q9NP64 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZCCHC17Q9NP64 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ZCCHC17Q9NP64 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZCCHC17Q9NP64 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZCCHC17Q9NP64 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZCCHC17Q9NP64 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZCCHC17Q9NP64 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZCCHC17Q9NP64 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZCCHC17Q9NP64 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZCCHC17Q9NP64 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZCCHC17Q9NP64 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZCCHC17Q9NP64 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZCCHC17Q9NP64 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZCCHC17Q9NP64 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZCCHC17Q9NP64 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZCCHC17Q9NP64 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZCCHC17Q9NP64 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZCCHC17Q9NP64 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZCCHC17Q9NP64 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZCCHC17Q9NP64 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZCCHC17Q9NP64 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZCCHC17Q9NP64 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZCCHC17Q9NP64 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZCCHC17Q9NP64 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZCCHC17Q9NP64 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZCCHC17Q9NP64 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZCCHC17Q9NP64 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ZCCHC17Q9NP64 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZCCHC17Q9NP64 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZCCHC17Q9NP64 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZCCHC17Q9NP64 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZCCHC17Q9NP64 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZCCHC17Q9NP64 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZCCHC17Q9NP64 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZCCHC17Q9NP64 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZCCHC17Q9NP64 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZCCHC17Q9NP64 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZCCHC17Q9NP64 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZCCHC17Q9NP64 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZCCHC17Q9NP64 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZCCHC17Q9NP64 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZCCHC17Q9NP64 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZCCHC17Q9NP64 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZCCHC17Q9NP64 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZCCHC17Q9NP64 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZCCHC17Q9NP64 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZCCHC17Q9NP64 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZCCHC17Q9NP64 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZCCHC17Q9NP64 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZCCHC17Q9NP64 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZCCHC17Q9NP64 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZCCHC17Q9NP64 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZCCHC17Q9NP64 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZCCHC17Q9NP64 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZCCHC17Q9NP64 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZCCHC17Q9NP64 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZCCHC17Q9NP64 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ZCCHC17Q9NP64 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZCCHC17Q9NP64 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZCCHC17Q9NP64 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ZCCHC17Q9NP64 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ZCCHC17Q9NP64 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ZCCHC17Q9NP64 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZCCHC17Q9NP64 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZCCHC17Q9NP64 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZCCHC17Q9NP64 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZCCHC17Q9NP64 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZCCHC17Q9NP64 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZCCHC17Q9NP64 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZCCHC17Q9NP64 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZCCHC17Q9NP64 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZCCHC17Q9NP64 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZCCHC17Q9NP64 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZCCHC17Q9NP64 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZCCHC17Q9NP64 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ZCCHC17Q9NP64 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZCCHC17Q9NP64 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZCCHC17Q9NP64 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZCCHC17Q9NP64 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZCCHC17Q9NP64 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms