Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAB3

SLC52A2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A2Q9HAB3 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC52A2Q9HAB3 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC52A2Q9HAB3 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC52A2Q9HAB3 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC52A2Q9HAB3 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC52A2Q9HAB3 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC52A2Q9HAB3 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC52A2Q9HAB3 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC52A2Q9HAB3 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC52A2Q9HAB3 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC52A2Q9HAB3 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC52A2Q9HAB3 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC52A2Q9HAB3 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC52A2Q9HAB3 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC52A2Q9HAB3 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC52A2Q9HAB3 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC52A2Q9HAB3 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC52A2Q9HAB3 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC52A2Q9HAB3 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC52A2Q9HAB3 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC52A2Q9HAB3 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC52A2Q9HAB3 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC52A2Q9HAB3 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC52A2Q9HAB3 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC52A2Q9HAB3 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC52A2Q9HAB3 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC52A2Q9HAB3 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC52A2Q9HAB3 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC52A2Q9HAB3 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC52A2Q9HAB3 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC52A2Q9HAB3 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC52A2Q9HAB3 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC52A2Q9HAB3 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC52A2Q9HAB3 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC52A2Q9HAB3 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC52A2Q9HAB3 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC52A2Q9HAB3 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC52A2Q9HAB3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC52A2Q9HAB3 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC52A2Q9HAB3 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC52A2Q9HAB3 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC52A2Q9HAB3 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC52A2Q9HAB3 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC52A2Q9HAB3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC52A2Q9HAB3 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC52A2Q9HAB3 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC52A2Q9HAB3 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC52A2Q9HAB3 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC52A2Q9HAB3 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC52A2Q9HAB3 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC52A2Q9HAB3 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC52A2Q9HAB3 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC52A2Q9HAB3 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC52A2Q9HAB3 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC52A2Q9HAB3 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC52A2Q9HAB3 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC52A2Q9HAB3 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC52A2Q9HAB3 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC52A2Q9HAB3 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC52A2Q9HAB3 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC52A2Q9HAB3 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC52A2Q9HAB3 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC52A2Q9HAB3 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC52A2Q9HAB3 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC52A2Q9HAB3 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC52A2Q9HAB3 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC52A2Q9HAB3 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC52A2Q9HAB3 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC52A2Q9HAB3 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC52A2Q9HAB3 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC52A2Q9HAB3 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC52A2Q9HAB3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC52A2Q9HAB3 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC52A2Q9HAB3 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC52A2Q9HAB3 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC52A2Q9HAB3 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC52A2Q9HAB3 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC52A2Q9HAB3 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC52A2Q9HAB3 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC52A2Q9HAB3 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC52A2Q9HAB3 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC52A2Q9HAB3 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC52A2Q9HAB3 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC52A2Q9HAB3 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC52A2Q9HAB3 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC52A2Q9HAB3 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC52A2Q9HAB3 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC52A2Q9HAB3 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC52A2Q9HAB3 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC52A2Q9HAB3 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC52A2Q9HAB3 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC52A2Q9HAB3 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC52A2Q9HAB3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC52A2Q9HAB3 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC52A2Q9HAB3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC52A2Q9HAB3 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC52A2Q9HAB3 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC52A2Q9HAB3 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC52A2Q9HAB3 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC52A2Q9HAB3 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms