Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0U4

RAB1B, Ras-related protein Rab-1B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB1BQ9H0U4 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 288.2 ms