Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PAGR1Q9BTK6 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PAGR1Q9BTK6 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PAGR1Q9BTK6 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PAGR1Q9BTK6 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PAGR1Q9BTK6 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PAGR1Q9BTK6 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PAGR1Q9BTK6 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PAGR1Q9BTK6 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PAGR1Q9BTK6 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PAGR1Q9BTK6 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PAGR1Q9BTK6 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PAGR1Q9BTK6 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PAGR1Q9BTK6 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PAGR1Q9BTK6 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PAGR1Q9BTK6 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PAGR1Q9BTK6 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PAGR1Q9BTK6 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PAGR1Q9BTK6 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PAGR1Q9BTK6 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PAGR1Q9BTK6 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PAGR1Q9BTK6 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PAGR1Q9BTK6 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PAGR1Q9BTK6 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PAGR1Q9BTK6 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PAGR1Q9BTK6 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PAGR1Q9BTK6 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PAGR1Q9BTK6 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PAGR1Q9BTK6 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PAGR1Q9BTK6 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PAGR1Q9BTK6 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PAGR1Q9BTK6 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PAGR1Q9BTK6 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PAGR1Q9BTK6 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PAGR1Q9BTK6 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PAGR1Q9BTK6 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PAGR1Q9BTK6 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PAGR1Q9BTK6 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PAGR1Q9BTK6 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PAGR1Q9BTK6 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PAGR1Q9BTK6 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PAGR1Q9BTK6 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PAGR1Q9BTK6 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PAGR1Q9BTK6 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PAGR1Q9BTK6 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PAGR1Q9BTK6 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PAGR1Q9BTK6 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PAGR1Q9BTK6 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PAGR1Q9BTK6 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PAGR1Q9BTK6 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PAGR1Q9BTK6 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PAGR1Q9BTK6 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PAGR1Q9BTK6 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PAGR1Q9BTK6 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PAGR1Q9BTK6 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PAGR1Q9BTK6 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PAGR1Q9BTK6 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PAGR1Q9BTK6 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PAGR1Q9BTK6 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PAGR1Q9BTK6 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PAGR1Q9BTK6 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PAGR1Q9BTK6 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PAGR1Q9BTK6 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PAGR1Q9BTK6 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PAGR1Q9BTK6 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PAGR1Q9BTK6 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PAGR1Q9BTK6 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms