Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FYCO1Q9BQS8 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FYCO1Q9BQS8 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FYCO1Q9BQS8 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FYCO1Q9BQS8 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FYCO1Q9BQS8 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FYCO1Q9BQS8 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FYCO1Q9BQS8 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FYCO1Q9BQS8 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
FYCO1Q9BQS8 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
FYCO1Q9BQS8 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
FYCO1Q9BQS8 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
FYCO1Q9BQS8 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FYCO1Q9BQS8 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FYCO1Q9BQS8 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FYCO1Q9BQS8 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FYCO1Q9BQS8 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FYCO1Q9BQS8 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FYCO1Q9BQS8 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FYCO1Q9BQS8 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FYCO1Q9BQS8 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
FYCO1Q9BQS8 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FYCO1Q9BQS8 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FYCO1Q9BQS8 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
FYCO1Q9BQS8 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FYCO1Q9BQS8 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FYCO1Q9BQS8 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FYCO1Q9BQS8 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FYCO1Q9BQS8 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FYCO1Q9BQS8 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
FYCO1Q9BQS8 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FYCO1Q9BQS8 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FYCO1Q9BQS8 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FYCO1Q9BQS8 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FYCO1Q9BQS8 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
FYCO1Q9BQS8 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FYCO1Q9BQS8 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FYCO1Q9BQS8 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FYCO1Q9BQS8 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FYCO1Q9BQS8 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FYCO1Q9BQS8 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FYCO1Q9BQS8 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FYCO1Q9BQS8 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FYCO1Q9BQS8 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FYCO1Q9BQS8 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FYCO1Q9BQS8 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
FYCO1Q9BQS8 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
FYCO1Q9BQS8 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
FYCO1Q9BQS8 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
FYCO1Q9BQS8 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms