Protein–RNA interactions for Protein: Q96QV1

HHIP, Hedgehog-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHIPQ96QV1 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms