Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
LRRIQ1Q96JM4 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
LRRIQ1Q96JM4 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
LRRIQ1Q96JM4 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LRRIQ1Q96JM4 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LRRIQ1Q96JM4 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LRRIQ1Q96JM4 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LRRIQ1Q96JM4 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LRRIQ1Q96JM4 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LRRIQ1Q96JM4 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LRRIQ1Q96JM4 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LRRIQ1Q96JM4 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LRRIQ1Q96JM4 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LRRIQ1Q96JM4 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LRRIQ1Q96JM4 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LRRIQ1Q96JM4 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LRRIQ1Q96JM4 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LRRIQ1Q96JM4 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LRRIQ1Q96JM4 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
LRRIQ1Q96JM4 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LRRIQ1Q96JM4 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LRRIQ1Q96JM4 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LRRIQ1Q96JM4 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LRRIQ1Q96JM4 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LRRIQ1Q96JM4 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LRRIQ1Q96JM4 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LRRIQ1Q96JM4 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LRRIQ1Q96JM4 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LRRIQ1Q96JM4 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LRRIQ1Q96JM4 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
LRRIQ1Q96JM4 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LRRIQ1Q96JM4 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LRRIQ1Q96JM4 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LRRIQ1Q96JM4 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LRRIQ1Q96JM4 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LRRIQ1Q96JM4 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LRRIQ1Q96JM4 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LRRIQ1Q96JM4 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LRRIQ1Q96JM4 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRIQ1Q96JM4 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRIQ1Q96JM4 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRIQ1Q96JM4 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRIQ1Q96JM4 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRIQ1Q96JM4 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRIQ1Q96JM4 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRIQ1Q96JM4 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRIQ1Q96JM4 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRIQ1Q96JM4 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRIQ1Q96JM4 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRIQ1Q96JM4 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRIQ1Q96JM4 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRIQ1Q96JM4 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRIQ1Q96JM4 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRIQ1Q96JM4 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRIQ1Q96JM4 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRIQ1Q96JM4 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRIQ1Q96JM4 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRIQ1Q96JM4 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRIQ1Q96JM4 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRIQ1Q96JM4 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRIQ1Q96JM4 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRIQ1Q96JM4 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRIQ1Q96JM4 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRIQ1Q96JM4 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRIQ1Q96JM4 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRIQ1Q96JM4 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRIQ1Q96JM4 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRIQ1Q96JM4 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRIQ1Q96JM4 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRIQ1Q96JM4 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LRRIQ1Q96JM4 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LRRIQ1Q96JM4 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LRRIQ1Q96JM4 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LRRIQ1Q96JM4 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LRRIQ1Q96JM4 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LRRIQ1Q96JM4 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LRRIQ1Q96JM4 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LRRIQ1Q96JM4 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LRRIQ1Q96JM4 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LRRIQ1Q96JM4 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LRRIQ1Q96JM4 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LRRIQ1Q96JM4 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LRRIQ1Q96JM4 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LRRIQ1Q96JM4 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LRRIQ1Q96JM4 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LRRIQ1Q96JM4 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LRRIQ1Q96JM4 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LRRIQ1Q96JM4 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LRRIQ1Q96JM4 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LRRIQ1Q96JM4 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LRRIQ1Q96JM4 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LRRIQ1Q96JM4 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LRRIQ1Q96JM4 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LRRIQ1Q96JM4 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LRRIQ1Q96JM4 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
LRRIQ1Q96JM4 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LRRIQ1Q96JM4 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
LRRIQ1Q96JM4 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LRRIQ1Q96JM4 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LRRIQ1Q96JM4 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
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