Protein–RNA interactions for Protein: Q96H22

CENPN, Centromere protein N, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPNQ96H22 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPNQ96H22 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPNQ96H22 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPNQ96H22 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPNQ96H22 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPNQ96H22 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPNQ96H22 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPNQ96H22 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPNQ96H22 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPNQ96H22 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPNQ96H22 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPNQ96H22 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPNQ96H22 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPNQ96H22 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms