Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA58

PNLDC1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNLDC1Q8NA58 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms