Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms