Protein–RNA interactions for Protein: Q86XW9

NME9, Thioredoxin domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME9Q86XW9 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NME9Q86XW9 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NME9Q86XW9 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NME9Q86XW9 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms