Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z739

YTHDF3, YTH domain-containing family protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF3Q7Z739 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms