Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTR5

CFAP47, Cilia- and flagella-associated protein 47, humanhuman

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Length 3,102 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP47Q6ZTR5 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CFAP47Q6ZTR5 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CFAP47Q6ZTR5 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CFAP47Q6ZTR5 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CFAP47Q6ZTR5 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CFAP47Q6ZTR5 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CFAP47Q6ZTR5 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CFAP47Q6ZTR5 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CFAP47Q6ZTR5 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CFAP47Q6ZTR5 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CFAP47Q6ZTR5 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CFAP47Q6ZTR5 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CFAP47Q6ZTR5 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CFAP47Q6ZTR5 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CFAP47Q6ZTR5 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CFAP47Q6ZTR5 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CFAP47Q6ZTR5 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CFAP47Q6ZTR5 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CFAP47Q6ZTR5 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CFAP47Q6ZTR5 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CFAP47Q6ZTR5 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CFAP47Q6ZTR5 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CFAP47Q6ZTR5 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CFAP47Q6ZTR5 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CFAP47Q6ZTR5 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CFAP47Q6ZTR5 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CFAP47Q6ZTR5 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CFAP47Q6ZTR5 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CFAP47Q6ZTR5 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CFAP47Q6ZTR5 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CFAP47Q6ZTR5 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CFAP47Q6ZTR5 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CFAP47Q6ZTR5 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CFAP47Q6ZTR5 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CFAP47Q6ZTR5 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CFAP47Q6ZTR5 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CFAP47Q6ZTR5 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CFAP47Q6ZTR5 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CFAP47Q6ZTR5 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CFAP47Q6ZTR5 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CFAP47Q6ZTR5 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CFAP47Q6ZTR5 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CFAP47Q6ZTR5 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CFAP47Q6ZTR5 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CFAP47Q6ZTR5 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CFAP47Q6ZTR5 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CFAP47Q6ZTR5 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CFAP47Q6ZTR5 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CFAP47Q6ZTR5 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CFAP47Q6ZTR5 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CFAP47Q6ZTR5 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CFAP47Q6ZTR5 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CFAP47Q6ZTR5 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CFAP47Q6ZTR5 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CFAP47Q6ZTR5 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CFAP47Q6ZTR5 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CFAP47Q6ZTR5 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CFAP47Q6ZTR5 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CFAP47Q6ZTR5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CFAP47Q6ZTR5 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CFAP47Q6ZTR5 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CFAP47Q6ZTR5 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CFAP47Q6ZTR5 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CFAP47Q6ZTR5 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CFAP47Q6ZTR5 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CFAP47Q6ZTR5 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CFAP47Q6ZTR5 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CFAP47Q6ZTR5 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CFAP47Q6ZTR5 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CFAP47Q6ZTR5 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CFAP47Q6ZTR5 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CFAP47Q6ZTR5 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CFAP47Q6ZTR5 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CFAP47Q6ZTR5 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CFAP47Q6ZTR5 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CFAP47Q6ZTR5 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CFAP47Q6ZTR5 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CFAP47Q6ZTR5 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CFAP47Q6ZTR5 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CFAP47Q6ZTR5 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CFAP47Q6ZTR5 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CFAP47Q6ZTR5 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CFAP47Q6ZTR5 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CFAP47Q6ZTR5 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CFAP47Q6ZTR5 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CFAP47Q6ZTR5 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CFAP47Q6ZTR5 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CFAP47Q6ZTR5 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CFAP47Q6ZTR5 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CFAP47Q6ZTR5 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CFAP47Q6ZTR5 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CFAP47Q6ZTR5 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CFAP47Q6ZTR5 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CFAP47Q6ZTR5 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CFAP47Q6ZTR5 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CFAP47Q6ZTR5 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CFAP47Q6ZTR5 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CFAP47Q6ZTR5 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CFAP47Q6ZTR5 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CFAP47Q6ZTR5 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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