Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms