Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
STRIP1Q5VSL9 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
STRIP1Q5VSL9 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
STRIP1Q5VSL9 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
STRIP1Q5VSL9 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
STRIP1Q5VSL9 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
STRIP1Q5VSL9 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
STRIP1Q5VSL9 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
STRIP1Q5VSL9 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
STRIP1Q5VSL9 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
STRIP1Q5VSL9 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
STRIP1Q5VSL9 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
STRIP1Q5VSL9 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
STRIP1Q5VSL9 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
STRIP1Q5VSL9 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms