Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NCOA1Q15788 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
NCOA1Q15788 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NCOA1Q15788 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
NCOA1Q15788 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NCOA1Q15788 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
NCOA1Q15788 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
NCOA1Q15788 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NCOA1Q15788 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
NCOA1Q15788 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NCOA1Q15788 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NCOA1Q15788 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NCOA1Q15788 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NCOA1Q15788 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NCOA1Q15788 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NCOA1Q15788 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NCOA1Q15788 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NCOA1Q15788 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NCOA1Q15788 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NCOA1Q15788 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NCOA1Q15788 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NCOA1Q15788 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NCOA1Q15788 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NCOA1Q15788 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NCOA1Q15788 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NCOA1Q15788 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NCOA1Q15788 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NCOA1Q15788 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NCOA1Q15788 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NCOA1Q15788 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NCOA1Q15788 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NCOA1Q15788 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NCOA1Q15788 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
NCOA1Q15788 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
NCOA1Q15788 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NCOA1Q15788 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NCOA1Q15788 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NCOA1Q15788 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NCOA1Q15788 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NCOA1Q15788 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NCOA1Q15788 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NCOA1Q15788 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NCOA1Q15788 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
NCOA1Q15788 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NCOA1Q15788 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NCOA1Q15788 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
NCOA1Q15788 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NCOA1Q15788 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NCOA1Q15788 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NCOA1Q15788 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NCOA1Q15788 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NCOA1Q15788 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NCOA1Q15788 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NCOA1Q15788 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NCOA1Q15788 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NCOA1Q15788 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NCOA1Q15788 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
NCOA1Q15788 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
NCOA1Q15788 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NCOA1Q15788 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NCOA1Q15788 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NCOA1Q15788 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NCOA1Q15788 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NCOA1Q15788 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
NCOA1Q15788 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
NCOA1Q15788 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
NCOA1Q15788 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NCOA1Q15788 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NCOA1Q15788 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NCOA1Q15788 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NCOA1Q15788 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NCOA1Q15788 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NCOA1Q15788 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
NCOA1Q15788 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NCOA1Q15788 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NCOA1Q15788 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NCOA1Q15788 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NCOA1Q15788 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NCOA1Q15788 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
NCOA1Q15788 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NCOA1Q15788 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NCOA1Q15788 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NCOA1Q15788 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NCOA1Q15788 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NCOA1Q15788 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NCOA1Q15788 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NCOA1Q15788 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NCOA1Q15788 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NCOA1Q15788 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NCOA1Q15788 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NCOA1Q15788 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NCOA1Q15788 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NCOA1Q15788 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NCOA1Q15788 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NCOA1Q15788 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NCOA1Q15788 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NCOA1Q15788 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NCOA1Q15788 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NCOA1Q15788 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NCOA1Q15788 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms