Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
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