Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.83
NCAPHQ15003 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
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