Protein–RNA interactions for Protein: Q14213

EBI3, Interleukin-27 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBI3Q14213 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EBI3Q14213 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EBI3Q14213 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EBI3Q14213 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
EBI3Q14213 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
EBI3Q14213 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EBI3Q14213 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
EBI3Q14213 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
EBI3Q14213 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
EBI3Q14213 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
EBI3Q14213 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
EBI3Q14213 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
EBI3Q14213 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
EBI3Q14213 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
EBI3Q14213 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
EBI3Q14213 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
EBI3Q14213 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
EBI3Q14213 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
EBI3Q14213 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
EBI3Q14213 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
EBI3Q14213 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
EBI3Q14213 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
EBI3Q14213 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
EBI3Q14213 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
EBI3Q14213 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
EBI3Q14213 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
EBI3Q14213 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
EBI3Q14213 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
EBI3Q14213 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
EBI3Q14213 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
EBI3Q14213 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
EBI3Q14213 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
EBI3Q14213 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
EBI3Q14213 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
EBI3Q14213 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
EBI3Q14213 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
EBI3Q14213 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
EBI3Q14213 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
EBI3Q14213 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
EBI3Q14213 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
EBI3Q14213 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
EBI3Q14213 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
EBI3Q14213 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
EBI3Q14213 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
EBI3Q14213 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
EBI3Q14213 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
EBI3Q14213 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
EBI3Q14213 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
EBI3Q14213 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
EBI3Q14213 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EBI3Q14213 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EBI3Q14213 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EBI3Q14213 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EBI3Q14213 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EBI3Q14213 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EBI3Q14213 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EBI3Q14213 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EBI3Q14213 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
EBI3Q14213 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EBI3Q14213 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EBI3Q14213 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EBI3Q14213 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EBI3Q14213 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
EBI3Q14213 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EBI3Q14213 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EBI3Q14213 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EBI3Q14213 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EBI3Q14213 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EBI3Q14213 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EBI3Q14213 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EBI3Q14213 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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EBI3Q14213 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EBI3Q14213 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
EBI3Q14213 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EBI3Q14213 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EBI3Q14213 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EBI3Q14213 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EBI3Q14213 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EBI3Q14213 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EBI3Q14213 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EBI3Q14213 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EBI3Q14213 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EBI3Q14213 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EBI3Q14213 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EBI3Q14213 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EBI3Q14213 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EBI3Q14213 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EBI3Q14213 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EBI3Q14213 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EBI3Q14213 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EBI3Q14213 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EBI3Q14213 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EBI3Q14213 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EBI3Q14213 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EBI3Q14213 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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