Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms