Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 LMO3-212ENST00000535535 1488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 QTRT2-209ENST00000479882 1196 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
MKRN4PQ13434 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
MKRN4PQ13434 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
MKRN4PQ13434 H3F3A-201ENST00000366813 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
MKRN4PQ13434 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MKRN4PQ13434 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MKRN4PQ13434 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MKRN4PQ13434 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MKRN4PQ13434 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MKRN4PQ13434 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MKRN4PQ13434 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MKRN4PQ13434 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
MKRN4PQ13434 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MKRN4PQ13434 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MKRN4PQ13434 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
MKRN4PQ13434 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
MKRN4PQ13434 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MKRN4PQ13434 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MKRN4PQ13434 AL137246.1-201ENST00000607072 977 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
MKRN4PQ13434 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MKRN4PQ13434 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MKRN4PQ13434 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MKRN4PQ13434 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MKRN4PQ13434 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
MKRN4PQ13434 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MKRN4PQ13434 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MKRN4PQ13434 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MKRN4PQ13434 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MKRN4PQ13434 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MKRN4PQ13434 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MKRN4PQ13434 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MKRN4PQ13434 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MKRN4PQ13434 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MKRN4PQ13434 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MKRN4PQ13434 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MKRN4PQ13434 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MKRN4PQ13434 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MKRN4PQ13434 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MKRN4PQ13434 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MKRN4PQ13434 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MKRN4PQ13434 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
MKRN4PQ13434 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MKRN4PQ13434 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MKRN4PQ13434 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MKRN4PQ13434 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MKRN4PQ13434 AC092925.1-201ENST00000470739 493 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MKRN4PQ13434 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MKRN4PQ13434 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MKRN4PQ13434 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MKRN4PQ13434 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MKRN4PQ13434 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
MKRN4PQ13434 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MKRN4PQ13434 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MKRN4PQ13434 METTL15-210ENST00000634721 1182 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MKRN4PQ13434 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MKRN4PQ13434 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MKRN4PQ13434 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
MKRN4PQ13434 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MKRN4PQ13434 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MKRN4PQ13434 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MKRN4PQ13434 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MKRN4PQ13434 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MKRN4PQ13434 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MKRN4PQ13434 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MKRN4PQ13434 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MKRN4PQ13434 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MKRN4PQ13434 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MKRN4PQ13434 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MKRN4PQ13434 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MKRN4PQ13434 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MKRN4PQ13434 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MKRN4PQ13434 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MKRN4PQ13434 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms