Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TCOF1Q13428 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
TCOF1Q13428 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TCOF1Q13428 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TCOF1Q13428 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TCOF1Q13428 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TCOF1Q13428 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TCOF1Q13428 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TCOF1Q13428 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TCOF1Q13428 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TCOF1Q13428 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TCOF1Q13428 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TCOF1Q13428 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TCOF1Q13428 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TCOF1Q13428 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TCOF1Q13428 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
TCOF1Q13428 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
TCOF1Q13428 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TCOF1Q13428 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TCOF1Q13428 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TCOF1Q13428 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TCOF1Q13428 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TCOF1Q13428 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TCOF1Q13428 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TCOF1Q13428 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TCOF1Q13428 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TCOF1Q13428 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TCOF1Q13428 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TCOF1Q13428 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TCOF1Q13428 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TCOF1Q13428 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TCOF1Q13428 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TCOF1Q13428 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TCOF1Q13428 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TCOF1Q13428 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TCOF1Q13428 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TCOF1Q13428 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TCOF1Q13428 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TCOF1Q13428 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
TCOF1Q13428 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TCOF1Q13428 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TCOF1Q13428 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TCOF1Q13428 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TCOF1Q13428 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TCOF1Q13428 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TCOF1Q13428 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TCOF1Q13428 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TCOF1Q13428 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TCOF1Q13428 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
TCOF1Q13428 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TCOF1Q13428 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TCOF1Q13428 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TCOF1Q13428 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
TCOF1Q13428 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TCOF1Q13428 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TCOF1Q13428 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TCOF1Q13428 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TCOF1Q13428 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TCOF1Q13428 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
TCOF1Q13428 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
TCOF1Q13428 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TCOF1Q13428 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TCOF1Q13428 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TCOF1Q13428 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TCOF1Q13428 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TCOF1Q13428 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TCOF1Q13428 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TCOF1Q13428 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TCOF1Q13428 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TCOF1Q13428 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TCOF1Q13428 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
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TCOF1Q13428 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TCOF1Q13428 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TCOF1Q13428 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TCOF1Q13428 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TCOF1Q13428 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
TCOF1Q13428 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TCOF1Q13428 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TCOF1Q13428 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TCOF1Q13428 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TCOF1Q13428 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
TCOF1Q13428 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TCOF1Q13428 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TCOF1Q13428 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TCOF1Q13428 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TCOF1Q13428 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TCOF1Q13428 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TCOF1Q13428 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TCOF1Q13428 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TCOF1Q13428 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
TCOF1Q13428 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TCOF1Q13428 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TCOF1Q13428 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
TCOF1Q13428 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
TCOF1Q13428 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
TCOF1Q13428 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TCOF1Q13428 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TCOF1Q13428 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TCOF1Q13428 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
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