Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
GOLGA3Q08378 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
GOLGA3Q08378 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
GOLGA3Q08378 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
GOLGA3Q08378 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
GOLGA3Q08378 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
GOLGA3Q08378 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
GOLGA3Q08378 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
GOLGA3Q08378 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
GOLGA3Q08378 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
GOLGA3Q08378 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
GOLGA3Q08378 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
GOLGA3Q08378 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
GOLGA3Q08378 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
GOLGA3Q08378 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
GOLGA3Q08378 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
GOLGA3Q08378 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
GOLGA3Q08378 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
GOLGA3Q08378 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
GOLGA3Q08378 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
GOLGA3Q08378 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC29.54■■■□□ 2.32
GOLGA3Q08378 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC29.54■■■□□ 2.32
GOLGA3Q08378 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
GOLGA3Q08378 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GOLGA3Q08378 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
GOLGA3Q08378 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GOLGA3Q08378 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GOLGA3Q08378 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
GOLGA3Q08378 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
GOLGA3Q08378 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
GOLGA3Q08378 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
GOLGA3Q08378 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
GOLGA3Q08378 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
GOLGA3Q08378 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
GOLGA3Q08378 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
GOLGA3Q08378 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GOLGA3Q08378 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GOLGA3Q08378 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GOLGA3Q08378 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
GOLGA3Q08378 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
GOLGA3Q08378 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
GOLGA3Q08378 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
GOLGA3Q08378 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GOLGA3Q08378 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GOLGA3Q08378 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
GOLGA3Q08378 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
GOLGA3Q08378 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
GOLGA3Q08378 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC29.51■■■□□ 2.32
GOLGA3Q08378 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
GOLGA3Q08378 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
GOLGA3Q08378 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
GOLGA3Q08378 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
GOLGA3Q08378 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
GOLGA3Q08378 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
GOLGA3Q08378 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
GOLGA3Q08378 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
GOLGA3Q08378 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
GOLGA3Q08378 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
GOLGA3Q08378 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
GOLGA3Q08378 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
GOLGA3Q08378 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
GOLGA3Q08378 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
GOLGA3Q08378 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
GOLGA3Q08378 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
GOLGA3Q08378 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
GOLGA3Q08378 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
GOLGA3Q08378 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
GOLGA3Q08378 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
GOLGA3Q08378 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
GOLGA3Q08378 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
GOLGA3Q08378 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
GOLGA3Q08378 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
GOLGA3Q08378 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
GOLGA3Q08378 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
GOLGA3Q08378 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
GOLGA3Q08378 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
GOLGA3Q08378 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
GOLGA3Q08378 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
GOLGA3Q08378 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
GOLGA3Q08378 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
GOLGA3Q08378 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
GOLGA3Q08378 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
GOLGA3Q08378 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
GOLGA3Q08378 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
GOLGA3Q08378 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
GOLGA3Q08378 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
GOLGA3Q08378 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
GOLGA3Q08378 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
GOLGA3Q08378 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
GOLGA3Q08378 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
GOLGA3Q08378 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
GOLGA3Q08378 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
GOLGA3Q08378 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
GOLGA3Q08378 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
GOLGA3Q08378 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
GOLGA3Q08378 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
GOLGA3Q08378 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
GOLGA3Q08378 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
GOLGA3Q08378 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
GOLGA3Q08378 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms