Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms