Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VLDLRP98155 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VLDLRP98155 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VLDLRP98155 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VLDLRP98155 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VLDLRP98155 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
VLDLRP98155 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VLDLRP98155 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VLDLRP98155 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VLDLRP98155 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VLDLRP98155 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VLDLRP98155 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VLDLRP98155 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VLDLRP98155 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VLDLRP98155 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VLDLRP98155 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VLDLRP98155 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VLDLRP98155 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VLDLRP98155 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VLDLRP98155 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VLDLRP98155 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VLDLRP98155 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VLDLRP98155 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VLDLRP98155 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VLDLRP98155 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VLDLRP98155 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VLDLRP98155 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VLDLRP98155 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VLDLRP98155 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VLDLRP98155 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VLDLRP98155 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VLDLRP98155 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VLDLRP98155 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VLDLRP98155 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VLDLRP98155 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VLDLRP98155 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VLDLRP98155 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VLDLRP98155 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VLDLRP98155 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VLDLRP98155 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VLDLRP98155 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VLDLRP98155 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VLDLRP98155 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VLDLRP98155 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VLDLRP98155 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VLDLRP98155 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VLDLRP98155 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VLDLRP98155 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VLDLRP98155 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VLDLRP98155 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VLDLRP98155 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
VLDLRP98155 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VLDLRP98155 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VLDLRP98155 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VLDLRP98155 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VLDLRP98155 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VLDLRP98155 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
VLDLRP98155 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VLDLRP98155 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VLDLRP98155 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VLDLRP98155 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VLDLRP98155 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VLDLRP98155 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VLDLRP98155 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VLDLRP98155 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VLDLRP98155 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
VLDLRP98155 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
VLDLRP98155 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
VLDLRP98155 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VLDLRP98155 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VLDLRP98155 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VLDLRP98155 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VLDLRP98155 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VLDLRP98155 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VLDLRP98155 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VLDLRP98155 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VLDLRP98155 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VLDLRP98155 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VLDLRP98155 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VLDLRP98155 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VLDLRP98155 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VLDLRP98155 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VLDLRP98155 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VLDLRP98155 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VLDLRP98155 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VLDLRP98155 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VLDLRP98155 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VLDLRP98155 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VLDLRP98155 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VLDLRP98155 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VLDLRP98155 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VLDLRP98155 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VLDLRP98155 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VLDLRP98155 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VLDLRP98155 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VLDLRP98155 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
VLDLRP98155 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VLDLRP98155 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VLDLRP98155 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VLDLRP98155 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms