Protein–RNA interactions for Protein: P61009

SPCS3, Signal peptidase complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS3P61009 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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SPCS3P61009 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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SPCS3P61009 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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SPCS3P61009 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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SPCS3P61009 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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SPCS3P61009 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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