Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTBP60709 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTBP60709 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTBP60709 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTBP60709 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTBP60709 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTBP60709 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTBP60709 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTBP60709 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTBP60709 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTBP60709 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTBP60709 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTBP60709 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTBP60709 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTBP60709 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTBP60709 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTBP60709 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTBP60709 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTBP60709 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTBP60709 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTBP60709 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTBP60709 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTBP60709 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTBP60709 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTBP60709 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTBP60709 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTBP60709 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTBP60709 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTBP60709 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTBP60709 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTBP60709 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTBP60709 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTBP60709 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTBP60709 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTBP60709 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTBP60709 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTBP60709 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTBP60709 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTBP60709 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTBP60709 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTBP60709 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTBP60709 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTBP60709 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTBP60709 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTBP60709 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTBP60709 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTBP60709 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTBP60709 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTBP60709 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTBP60709 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTBP60709 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTBP60709 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTBP60709 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTBP60709 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTBP60709 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTBP60709 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTBP60709 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTBP60709 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTBP60709 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTBP60709 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTBP60709 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTBP60709 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTBP60709 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTBP60709 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTBP60709 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTBP60709 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTBP60709 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTBP60709 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTBP60709 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTBP60709 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTBP60709 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTBP60709 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTBP60709 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTBP60709 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTBP60709 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTBP60709 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTBP60709 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTBP60709 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTBP60709 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTBP60709 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTBP60709 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTBP60709 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTBP60709 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTBP60709 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTBP60709 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTBP60709 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTBP60709 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTBP60709 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTBP60709 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTBP60709 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTBP60709 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTBP60709 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTBP60709 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTBP60709 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTBP60709 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTBP60709 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTBP60709 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTBP60709 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTBP60709 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTBP60709 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms