Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOSBP53539 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOSBP53539 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOSBP53539 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOSBP53539 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOSBP53539 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOSBP53539 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOSBP53539 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOSBP53539 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOSBP53539 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOSBP53539 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOSBP53539 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOSBP53539 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOSBP53539 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FOSBP53539 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOSBP53539 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOSBP53539 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOSBP53539 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOSBP53539 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FOSBP53539 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOSBP53539 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOSBP53539 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOSBP53539 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOSBP53539 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOSBP53539 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOSBP53539 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOSBP53539 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOSBP53539 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOSBP53539 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOSBP53539 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOSBP53539 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOSBP53539 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOSBP53539 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOSBP53539 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOSBP53539 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOSBP53539 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
FOSBP53539 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOSBP53539 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOSBP53539 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOSBP53539 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOSBP53539 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOSBP53539 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
FOSBP53539 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOSBP53539 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOSBP53539 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOSBP53539 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOSBP53539 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOSBP53539 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOSBP53539 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FOSBP53539 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FOSBP53539 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FOSBP53539 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FOSBP53539 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FOSBP53539 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FOSBP53539 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FOSBP53539 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FOSBP53539 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FOSBP53539 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOSBP53539 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOSBP53539 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOSBP53539 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOSBP53539 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOSBP53539 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOSBP53539 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOSBP53539 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOSBP53539 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOSBP53539 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOSBP53539 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOSBP53539 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOSBP53539 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOSBP53539 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
FOSBP53539 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOSBP53539 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOSBP53539 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOSBP53539 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOSBP53539 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOSBP53539 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOSBP53539 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOSBP53539 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOSBP53539 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOSBP53539 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOSBP53539 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOSBP53539 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOSBP53539 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOSBP53539 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOSBP53539 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
FOSBP53539 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOSBP53539 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOSBP53539 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOSBP53539 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOSBP53539 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOSBP53539 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOSBP53539 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOSBP53539 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOSBP53539 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOSBP53539 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOSBP53539 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOSBP53539 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOSBP53539 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOSBP53539 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms