Protein–RNA interactions for Protein: P53396

ACLY, ATP-citrate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACLYP53396 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACLYP53396 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACLYP53396 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACLYP53396 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACLYP53396 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACLYP53396 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACLYP53396 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACLYP53396 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACLYP53396 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ACLYP53396 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACLYP53396 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACLYP53396 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACLYP53396 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACLYP53396 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACLYP53396 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACLYP53396 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACLYP53396 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACLYP53396 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACLYP53396 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACLYP53396 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACLYP53396 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ACLYP53396 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ACLYP53396 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACLYP53396 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACLYP53396 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACLYP53396 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACLYP53396 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACLYP53396 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ACLYP53396 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACLYP53396 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACLYP53396 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACLYP53396 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACLYP53396 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACLYP53396 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACLYP53396 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACLYP53396 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ACLYP53396 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACLYP53396 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACLYP53396 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACLYP53396 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACLYP53396 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACLYP53396 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACLYP53396 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACLYP53396 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACLYP53396 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACLYP53396 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACLYP53396 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACLYP53396 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACLYP53396 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACLYP53396 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACLYP53396 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACLYP53396 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACLYP53396 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACLYP53396 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACLYP53396 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACLYP53396 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACLYP53396 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACLYP53396 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACLYP53396 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACLYP53396 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACLYP53396 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACLYP53396 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACLYP53396 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACLYP53396 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACLYP53396 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACLYP53396 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACLYP53396 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACLYP53396 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACLYP53396 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACLYP53396 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACLYP53396 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACLYP53396 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACLYP53396 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACLYP53396 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACLYP53396 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACLYP53396 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACLYP53396 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACLYP53396 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACLYP53396 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACLYP53396 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACLYP53396 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACLYP53396 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ACLYP53396 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACLYP53396 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACLYP53396 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACLYP53396 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACLYP53396 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACLYP53396 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACLYP53396 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACLYP53396 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ACLYP53396 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACLYP53396 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ACLYP53396 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ACLYP53396 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACLYP53396 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACLYP53396 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACLYP53396 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACLYP53396 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACLYP53396 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACLYP53396 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms