Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
SMARCA2P51531 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
SMARCA2P51531 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
SMARCA2P51531 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
SMARCA2P51531 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
SMARCA2P51531 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
SMARCA2P51531 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.37■■■□□ 2.77
SMARCA2P51531 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
SMARCA2P51531 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
SMARCA2P51531 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
SMARCA2P51531 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
SMARCA2P51531 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
SMARCA2P51531 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
SMARCA2P51531 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
SMARCA2P51531 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC32.36■■■□□ 2.77
SMARCA2P51531 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
SMARCA2P51531 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
SMARCA2P51531 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
SMARCA2P51531 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
SMARCA2P51531 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
SMARCA2P51531 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
SMARCA2P51531 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
SMARCA2P51531 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
SMARCA2P51531 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
SMARCA2P51531 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
SMARCA2P51531 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
SMARCA2P51531 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
SMARCA2P51531 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
SMARCA2P51531 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
SMARCA2P51531 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
SMARCA2P51531 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
SMARCA2P51531 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
SMARCA2P51531 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
SMARCA2P51531 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
SMARCA2P51531 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
SMARCA2P51531 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
SMARCA2P51531 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
SMARCA2P51531 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
SMARCA2P51531 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
SMARCA2P51531 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
SMARCA2P51531 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
SMARCA2P51531 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
SMARCA2P51531 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
SMARCA2P51531 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
SMARCA2P51531 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
SMARCA2P51531 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
SMARCA2P51531 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC32.34■■■□□ 2.77
SMARCA2P51531 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
SMARCA2P51531 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
SMARCA2P51531 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
SMARCA2P51531 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
SMARCA2P51531 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
SMARCA2P51531 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
SMARCA2P51531 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
SMARCA2P51531 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
SMARCA2P51531 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
SMARCA2P51531 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
SMARCA2P51531 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
SMARCA2P51531 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
SMARCA2P51531 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
SMARCA2P51531 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
SMARCA2P51531 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
SMARCA2P51531 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
SMARCA2P51531 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
SMARCA2P51531 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
SMARCA2P51531 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
SMARCA2P51531 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
SMARCA2P51531 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
SMARCA2P51531 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
SMARCA2P51531 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
SMARCA2P51531 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
SMARCA2P51531 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.77
SMARCA2P51531 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
SMARCA2P51531 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC32.32■■■□□ 2.77
SMARCA2P51531 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC32.32■■■□□ 2.77
SMARCA2P51531 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
SMARCA2P51531 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
SMARCA2P51531 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
SMARCA2P51531 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
SMARCA2P51531 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
SMARCA2P51531 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
SMARCA2P51531 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
SMARCA2P51531 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
SMARCA2P51531 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
SMARCA2P51531 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
SMARCA2P51531 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
SMARCA2P51531 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
SMARCA2P51531 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
SMARCA2P51531 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
SMARCA2P51531 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
SMARCA2P51531 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
SMARCA2P51531 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
SMARCA2P51531 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
SMARCA2P51531 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
SMARCA2P51531 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC32.31■■■□□ 2.76
SMARCA2P51531 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
SMARCA2P51531 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
SMARCA2P51531 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
SMARCA2P51531 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
SMARCA2P51531 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms