Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERFP50548 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERFP50548 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERFP50548 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERFP50548 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERFP50548 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERFP50548 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERFP50548 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERFP50548 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERFP50548 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ERFP50548 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ERFP50548 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERFP50548 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERFP50548 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERFP50548 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERFP50548 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERFP50548 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERFP50548 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERFP50548 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERFP50548 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ERFP50548 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERFP50548 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERFP50548 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERFP50548 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERFP50548 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ERFP50548 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERFP50548 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERFP50548 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERFP50548 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERFP50548 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERFP50548 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERFP50548 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERFP50548 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERFP50548 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERFP50548 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERFP50548 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERFP50548 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERFP50548 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERFP50548 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERFP50548 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERFP50548 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERFP50548 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERFP50548 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERFP50548 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERFP50548 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERFP50548 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERFP50548 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ERFP50548 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERFP50548 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERFP50548 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERFP50548 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERFP50548 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERFP50548 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERFP50548 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERFP50548 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERFP50548 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERFP50548 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERFP50548 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERFP50548 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERFP50548 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERFP50548 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERFP50548 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERFP50548 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERFP50548 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERFP50548 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERFP50548 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERFP50548 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERFP50548 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERFP50548 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERFP50548 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERFP50548 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERFP50548 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERFP50548 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERFP50548 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERFP50548 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ERFP50548 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERFP50548 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERFP50548 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERFP50548 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERFP50548 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERFP50548 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERFP50548 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERFP50548 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERFP50548 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERFP50548 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERFP50548 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERFP50548 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERFP50548 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERFP50548 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERFP50548 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERFP50548 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERFP50548 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERFP50548 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERFP50548 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERFP50548 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERFP50548 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERFP50548 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERFP50548 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERFP50548 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERFP50548 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms