Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms