Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DNMT1P26358 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
DNMT1P26358 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
DNMT1P26358 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
DNMT1P26358 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DNMT1P26358 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
DNMT1P26358 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
DNMT1P26358 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
DNMT1P26358 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
DNMT1P26358 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
DNMT1P26358 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
DNMT1P26358 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
DNMT1P26358 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DNMT1P26358 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DNMT1P26358 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DNMT1P26358 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
DNMT1P26358 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
DNMT1P26358 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
DNMT1P26358 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
DNMT1P26358 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
DNMT1P26358 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
DNMT1P26358 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
DNMT1P26358 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
DNMT1P26358 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
DNMT1P26358 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
DNMT1P26358 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
DNMT1P26358 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
DNMT1P26358 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
DNMT1P26358 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
DNMT1P26358 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
DNMT1P26358 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
DNMT1P26358 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
DNMT1P26358 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
DNMT1P26358 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
DNMT1P26358 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
DNMT1P26358 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
DNMT1P26358 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
DNMT1P26358 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
DNMT1P26358 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DNMT1P26358 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
DNMT1P26358 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DNMT1P26358 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
DNMT1P26358 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DNMT1P26358 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DNMT1P26358 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DNMT1P26358 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
DNMT1P26358 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DNMT1P26358 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DNMT1P26358 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DNMT1P26358 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DNMT1P26358 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
DNMT1P26358 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
DNMT1P26358 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
DNMT1P26358 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
DNMT1P26358 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
DNMT1P26358 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
DNMT1P26358 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
DNMT1P26358 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DNMT1P26358 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
DNMT1P26358 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
DNMT1P26358 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DNMT1P26358 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
DNMT1P26358 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
DNMT1P26358 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
DNMT1P26358 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DNMT1P26358 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DNMT1P26358 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DNMT1P26358 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DNMT1P26358 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DNMT1P26358 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
DNMT1P26358 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
DNMT1P26358 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
DNMT1P26358 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DNMT1P26358 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
DNMT1P26358 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
DNMT1P26358 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
DNMT1P26358 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DNMT1P26358 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
DNMT1P26358 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DNMT1P26358 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DNMT1P26358 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
DNMT1P26358 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DNMT1P26358 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DNMT1P26358 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
DNMT1P26358 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
DNMT1P26358 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DNMT1P26358 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
DNMT1P26358 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
DNMT1P26358 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
DNMT1P26358 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DNMT1P26358 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DNMT1P26358 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DNMT1P26358 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
DNMT1P26358 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DNMT1P26358 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DNMT1P26358 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
DNMT1P26358 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
DNMT1P26358 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DNMT1P26358 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DNMT1P26358 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms