Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF1P21675 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF1P21675 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF1P21675 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF1P21675 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF1P21675 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF1P21675 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF1P21675 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF1P21675 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF1P21675 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF1P21675 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF1P21675 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF1P21675 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF1P21675 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF1P21675 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF1P21675 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF1P21675 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF1P21675 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF1P21675 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF1P21675 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF1P21675 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF1P21675 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF1P21675 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF1P21675 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF1P21675 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF1P21675 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF1P21675 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF1P21675 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF1P21675 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF1P21675 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF1P21675 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF1P21675 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF1P21675 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF1P21675 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF1P21675 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF1P21675 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF1P21675 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF1P21675 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TAF1P21675 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TAF1P21675 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TAF1P21675 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TAF1P21675 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TAF1P21675 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TAF1P21675 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TAF1P21675 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TAF1P21675 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TAF1P21675 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TAF1P21675 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TAF1P21675 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TAF1P21675 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TAF1P21675 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TAF1P21675 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TAF1P21675 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TAF1P21675 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TAF1P21675 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TAF1P21675 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TAF1P21675 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF1P21675 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF1P21675 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF1P21675 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF1P21675 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF1P21675 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF1P21675 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF1P21675 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF1P21675 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF1P21675 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF1P21675 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF1P21675 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF1P21675 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF1P21675 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF1P21675 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF1P21675 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF1P21675 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF1P21675 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF1P21675 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF1P21675 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF1P21675 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF1P21675 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF1P21675 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF1P21675 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF1P21675 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF1P21675 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF1P21675 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF1P21675 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF1P21675 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF1P21675 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TAF1P21675 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TAF1P21675 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TAF1P21675 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TAF1P21675 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TAF1P21675 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TAF1P21675 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TAF1P21675 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TAF1P21675 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TAF1P21675 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TAF1P21675 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TAF1P21675 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TAF1P21675 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TAF1P21675 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TAF1P21675 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms