Protein–RNA interactions for Protein: P19532

TFE3, Transcription factor E3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFE3P19532 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TFE3P19532 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TFE3P19532 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TFE3P19532 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TFE3P19532 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TFE3P19532 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TFE3P19532 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TFE3P19532 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TFE3P19532 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TFE3P19532 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TFE3P19532 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TFE3P19532 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TFE3P19532 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TFE3P19532 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TFE3P19532 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TFE3P19532 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TFE3P19532 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TFE3P19532 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TFE3P19532 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TFE3P19532 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TFE3P19532 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TFE3P19532 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TFE3P19532 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TFE3P19532 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TFE3P19532 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TFE3P19532 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TFE3P19532 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TFE3P19532 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TFE3P19532 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TFE3P19532 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TFE3P19532 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TFE3P19532 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TFE3P19532 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TFE3P19532 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TFE3P19532 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TFE3P19532 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TFE3P19532 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TFE3P19532 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TFE3P19532 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TFE3P19532 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TFE3P19532 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TFE3P19532 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TFE3P19532 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TFE3P19532 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TFE3P19532 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TFE3P19532 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TFE3P19532 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TFE3P19532 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TFE3P19532 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TFE3P19532 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TFE3P19532 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TFE3P19532 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TFE3P19532 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TFE3P19532 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TFE3P19532 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TFE3P19532 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TFE3P19532 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TFE3P19532 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TFE3P19532 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TFE3P19532 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TFE3P19532 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TFE3P19532 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TFE3P19532 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TFE3P19532 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TFE3P19532 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TFE3P19532 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TFE3P19532 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TFE3P19532 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TFE3P19532 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TFE3P19532 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TFE3P19532 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TFE3P19532 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TFE3P19532 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TFE3P19532 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TFE3P19532 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TFE3P19532 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TFE3P19532 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TFE3P19532 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TFE3P19532 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TFE3P19532 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TFE3P19532 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TFE3P19532 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TFE3P19532 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TFE3P19532 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TFE3P19532 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TFE3P19532 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TFE3P19532 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TFE3P19532 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TFE3P19532 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TFE3P19532 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TFE3P19532 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TFE3P19532 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TFE3P19532 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TFE3P19532 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TFE3P19532 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TFE3P19532 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TFE3P19532 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TFE3P19532 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TFE3P19532 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TFE3P19532 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms