Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms