Protein–RNA interactions for Protein: P02654

APOC1, Apolipoprotein C-I, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC1P02654 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC1P02654 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC1P02654 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC1P02654 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC1P02654 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC1P02654 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC1P02654 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC1P02654 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOC1P02654 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOC1P02654 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOC1P02654 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOC1P02654 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOC1P02654 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOC1P02654 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOC1P02654 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOC1P02654 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOC1P02654 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOC1P02654 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOC1P02654 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOC1P02654 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOC1P02654 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOC1P02654 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOC1P02654 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOC1P02654 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOC1P02654 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOC1P02654 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOC1P02654 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOC1P02654 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
APOC1P02654 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
APOC1P02654 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOC1P02654 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOC1P02654 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOC1P02654 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOC1P02654 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOC1P02654 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOC1P02654 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOC1P02654 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
APOC1P02654 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
APOC1P02654 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOC1P02654 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOC1P02654 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOC1P02654 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOC1P02654 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOC1P02654 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOC1P02654 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOC1P02654 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOC1P02654 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOC1P02654 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
APOC1P02654 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
APOC1P02654 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
APOC1P02654 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
APOC1P02654 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
APOC1P02654 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
APOC1P02654 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
APOC1P02654 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOC1P02654 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOC1P02654 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOC1P02654 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOC1P02654 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOC1P02654 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOC1P02654 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOC1P02654 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOC1P02654 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOC1P02654 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOC1P02654 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOC1P02654 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOC1P02654 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOC1P02654 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOC1P02654 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOC1P02654 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOC1P02654 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOC1P02654 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOC1P02654 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOC1P02654 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOC1P02654 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOC1P02654 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOC1P02654 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOC1P02654 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOC1P02654 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOC1P02654 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOC1P02654 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOC1P02654 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOC1P02654 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOC1P02654 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOC1P02654 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOC1P02654 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOC1P02654 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOC1P02654 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOC1P02654 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOC1P02654 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOC1P02654 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOC1P02654 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC1P02654 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC1P02654 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC1P02654 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC1P02654 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC1P02654 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC1P02654 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC1P02654 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC1P02654 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms