Protein–RNA interactions for Protein: P00533

EGFR, Epidermal growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFRP00533 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EGFRP00533 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EGFRP00533 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EGFRP00533 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EGFRP00533 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EGFRP00533 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EGFRP00533 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
EGFRP00533 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
EGFRP00533 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EGFRP00533 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EGFRP00533 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EGFRP00533 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EGFRP00533 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EGFRP00533 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EGFRP00533 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EGFRP00533 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EGFRP00533 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EGFRP00533 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EGFRP00533 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EGFRP00533 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EGFRP00533 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EGFRP00533 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
EGFRP00533 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EGFRP00533 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EGFRP00533 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EGFRP00533 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
EGFRP00533 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EGFRP00533 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EGFRP00533 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EGFRP00533 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EGFRP00533 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EGFRP00533 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EGFRP00533 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EGFRP00533 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EGFRP00533 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EGFRP00533 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EGFRP00533 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EGFRP00533 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EGFRP00533 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EGFRP00533 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EGFRP00533 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EGFRP00533 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EGFRP00533 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EGFRP00533 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EGFRP00533 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EGFRP00533 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EGFRP00533 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EGFRP00533 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EGFRP00533 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EGFRP00533 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EGFRP00533 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EGFRP00533 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EGFRP00533 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EGFRP00533 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EGFRP00533 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EGFRP00533 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EGFRP00533 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EGFRP00533 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
EGFRP00533 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EGFRP00533 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EGFRP00533 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EGFRP00533 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EGFRP00533 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EGFRP00533 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EGFRP00533 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EGFRP00533 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EGFRP00533 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EGFRP00533 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
EGFRP00533 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EGFRP00533 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EGFRP00533 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EGFRP00533 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EGFRP00533 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EGFRP00533 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EGFRP00533 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EGFRP00533 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EGFRP00533 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EGFRP00533 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EGFRP00533 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EGFRP00533 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
EGFRP00533 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EGFRP00533 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
EGFRP00533 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
EGFRP00533 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
EGFRP00533 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
EGFRP00533 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EGFRP00533 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EGFRP00533 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EGFRP00533 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EGFRP00533 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EGFRP00533 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EGFRP00533 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EGFRP00533 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EGFRP00533 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EGFRP00533 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EGFRP00533 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
EGFRP00533 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
EGFRP00533 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
EGFRP00533 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
EGFRP00533 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms