Protein–RNA interactions for Protein: O15178

T, Brachyury protein, humanhuman

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Length 435 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TO15178 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TO15178 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TO15178 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TO15178 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TO15178 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TO15178 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TO15178 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TO15178 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TO15178 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TO15178 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TO15178 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TO15178 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TO15178 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TO15178 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TO15178 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TO15178 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TO15178 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TO15178 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TO15178 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TO15178 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TO15178 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TO15178 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TO15178 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TO15178 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TO15178 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TO15178 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TO15178 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TO15178 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TO15178 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TO15178 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TO15178 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TO15178 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TO15178 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TO15178 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TO15178 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TO15178 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TO15178 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TO15178 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TO15178 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TO15178 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TO15178 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TO15178 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TO15178 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TO15178 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TO15178 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TO15178 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TO15178 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TO15178 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TO15178 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TO15178 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TO15178 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TO15178 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TO15178 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TO15178 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TO15178 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TO15178 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TO15178 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TO15178 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TO15178 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TO15178 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TO15178 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TO15178 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TO15178 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TO15178 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TO15178 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TO15178 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TO15178 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TO15178 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TO15178 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TO15178 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TO15178 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TO15178 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TO15178 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TO15178 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TO15178 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TO15178 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TO15178 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TO15178 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TO15178 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TO15178 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TO15178 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TO15178 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TO15178 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TO15178 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TO15178 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TO15178 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TO15178 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TO15178 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TO15178 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TO15178 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TO15178 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TO15178 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TO15178 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TO15178 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TO15178 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TO15178 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
TO15178 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TO15178 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TO15178 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TO15178 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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