Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms