Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SMIM1B2RUZ4 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SMIM1B2RUZ4 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SMIM1B2RUZ4 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SMIM1B2RUZ4 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SMIM1B2RUZ4 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SMIM1B2RUZ4 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SMIM1B2RUZ4 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SMIM1B2RUZ4 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SMIM1B2RUZ4 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SMIM1B2RUZ4 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SMIM1B2RUZ4 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SMIM1B2RUZ4 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SMIM1B2RUZ4 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SMIM1B2RUZ4 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SMIM1B2RUZ4 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SMIM1B2RUZ4 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SMIM1B2RUZ4 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SMIM1B2RUZ4 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SMIM1B2RUZ4 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SMIM1B2RUZ4 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SMIM1B2RUZ4 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SMIM1B2RUZ4 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SMIM1B2RUZ4 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SMIM1B2RUZ4 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SMIM1B2RUZ4 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SMIM1B2RUZ4 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SMIM1B2RUZ4 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SMIM1B2RUZ4 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SMIM1B2RUZ4 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SMIM1B2RUZ4 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SMIM1B2RUZ4 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SMIM1B2RUZ4 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SMIM1B2RUZ4 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SMIM1B2RUZ4 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SMIM1B2RUZ4 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SMIM1B2RUZ4 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SMIM1B2RUZ4 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
SMIM1B2RUZ4 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SMIM1B2RUZ4 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SMIM1B2RUZ4 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SMIM1B2RUZ4 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SMIM1B2RUZ4 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SMIM1B2RUZ4 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SMIM1B2RUZ4 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SMIM1B2RUZ4 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SMIM1B2RUZ4 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
SMIM1B2RUZ4 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SMIM1B2RUZ4 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SMIM1B2RUZ4 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SMIM1B2RUZ4 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SMIM1B2RUZ4 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SMIM1B2RUZ4 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SMIM1B2RUZ4 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SMIM1B2RUZ4 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SMIM1B2RUZ4 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SMIM1B2RUZ4 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SMIM1B2RUZ4 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SMIM1B2RUZ4 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SMIM1B2RUZ4 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SMIM1B2RUZ4 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SMIM1B2RUZ4 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SMIM1B2RUZ4 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SMIM1B2RUZ4 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SMIM1B2RUZ4 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SMIM1B2RUZ4 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SMIM1B2RUZ4 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SMIM1B2RUZ4 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SMIM1B2RUZ4 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SMIM1B2RUZ4 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SMIM1B2RUZ4 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SMIM1B2RUZ4 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SMIM1B2RUZ4 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SMIM1B2RUZ4 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SMIM1B2RUZ4 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SMIM1B2RUZ4 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SMIM1B2RUZ4 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SMIM1B2RUZ4 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
SMIM1B2RUZ4 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SMIM1B2RUZ4 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SMIM1B2RUZ4 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SMIM1B2RUZ4 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SMIM1B2RUZ4 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SMIM1B2RUZ4 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SMIM1B2RUZ4 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SMIM1B2RUZ4 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SMIM1B2RUZ4 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SMIM1B2RUZ4 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SMIM1B2RUZ4 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SMIM1B2RUZ4 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SMIM1B2RUZ4 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SMIM1B2RUZ4 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SMIM1B2RUZ4 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SMIM1B2RUZ4 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SMIM1B2RUZ4 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SMIM1B2RUZ4 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SMIM1B2RUZ4 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SMIM1B2RUZ4 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SMIM1B2RUZ4 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SMIM1B2RUZ4 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms