Protein–RNA interactions for Protein: A4D1E1

ZNF804B, Zinc finger protein 804B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF804BA4D1E1 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF804BA4D1E1 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF804BA4D1E1 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF804BA4D1E1 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF804BA4D1E1 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF804BA4D1E1 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF804BA4D1E1 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF804BA4D1E1 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF804BA4D1E1 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF804BA4D1E1 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF804BA4D1E1 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF804BA4D1E1 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF804BA4D1E1 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF804BA4D1E1 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF804BA4D1E1 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF804BA4D1E1 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF804BA4D1E1 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF804BA4D1E1 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF804BA4D1E1 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF804BA4D1E1 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF804BA4D1E1 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF804BA4D1E1 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF804BA4D1E1 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF804BA4D1E1 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF804BA4D1E1 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF804BA4D1E1 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF804BA4D1E1 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF804BA4D1E1 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF804BA4D1E1 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF804BA4D1E1 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF804BA4D1E1 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF804BA4D1E1 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF804BA4D1E1 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF804BA4D1E1 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF804BA4D1E1 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF804BA4D1E1 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF804BA4D1E1 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF804BA4D1E1 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF804BA4D1E1 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF804BA4D1E1 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF804BA4D1E1 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF804BA4D1E1 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF804BA4D1E1 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF804BA4D1E1 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF804BA4D1E1 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF804BA4D1E1 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF804BA4D1E1 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF804BA4D1E1 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF804BA4D1E1 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF804BA4D1E1 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF804BA4D1E1 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF804BA4D1E1 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF804BA4D1E1 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF804BA4D1E1 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF804BA4D1E1 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF804BA4D1E1 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF804BA4D1E1 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF804BA4D1E1 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF804BA4D1E1 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF804BA4D1E1 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ZNF804BA4D1E1 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ZNF804BA4D1E1 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ZNF804BA4D1E1 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ZNF804BA4D1E1 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF804BA4D1E1 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF804BA4D1E1 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF804BA4D1E1 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF804BA4D1E1 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF804BA4D1E1 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF804BA4D1E1 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF804BA4D1E1 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF804BA4D1E1 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF804BA4D1E1 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF804BA4D1E1 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF804BA4D1E1 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF804BA4D1E1 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF804BA4D1E1 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF804BA4D1E1 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF804BA4D1E1 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF804BA4D1E1 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF804BA4D1E1 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF804BA4D1E1 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF804BA4D1E1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF804BA4D1E1 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF804BA4D1E1 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF804BA4D1E1 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF804BA4D1E1 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF804BA4D1E1 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF804BA4D1E1 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF804BA4D1E1 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF804BA4D1E1 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF804BA4D1E1 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF804BA4D1E1 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF804BA4D1E1 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF804BA4D1E1 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF804BA4D1E1 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF804BA4D1E1 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF804BA4D1E1 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF804BA4D1E1 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF804BA4D1E1 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms