Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL3

CASP8AP2, CASP8-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,982 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP8AP2Q9UKL3 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CASP8AP2Q9UKL3 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CASP8AP2Q9UKL3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CASP8AP2Q9UKL3 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CASP8AP2Q9UKL3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CASP8AP2Q9UKL3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CASP8AP2Q9UKL3 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CASP8AP2Q9UKL3 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CASP8AP2Q9UKL3 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CASP8AP2Q9UKL3 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CASP8AP2Q9UKL3 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CASP8AP2Q9UKL3 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CASP8AP2Q9UKL3 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CASP8AP2Q9UKL3 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CASP8AP2Q9UKL3 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CASP8AP2Q9UKL3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CASP8AP2Q9UKL3 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CASP8AP2Q9UKL3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CASP8AP2Q9UKL3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CASP8AP2Q9UKL3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CASP8AP2Q9UKL3 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CASP8AP2Q9UKL3 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CASP8AP2Q9UKL3 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CASP8AP2Q9UKL3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CASP8AP2Q9UKL3 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CASP8AP2Q9UKL3 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CASP8AP2Q9UKL3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CASP8AP2Q9UKL3 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CASP8AP2Q9UKL3 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CASP8AP2Q9UKL3 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CASP8AP2Q9UKL3 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CASP8AP2Q9UKL3 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CASP8AP2Q9UKL3 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CASP8AP2Q9UKL3 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CASP8AP2Q9UKL3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CASP8AP2Q9UKL3 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CASP8AP2Q9UKL3 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CASP8AP2Q9UKL3 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CASP8AP2Q9UKL3 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CASP8AP2Q9UKL3 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CASP8AP2Q9UKL3 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CASP8AP2Q9UKL3 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CASP8AP2Q9UKL3 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CASP8AP2Q9UKL3 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CASP8AP2Q9UKL3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CASP8AP2Q9UKL3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CASP8AP2Q9UKL3 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CASP8AP2Q9UKL3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CASP8AP2Q9UKL3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CASP8AP2Q9UKL3 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CASP8AP2Q9UKL3 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CASP8AP2Q9UKL3 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CASP8AP2Q9UKL3 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CASP8AP2Q9UKL3 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CASP8AP2Q9UKL3 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CASP8AP2Q9UKL3 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CASP8AP2Q9UKL3 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CASP8AP2Q9UKL3 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CASP8AP2Q9UKL3 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CASP8AP2Q9UKL3 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CASP8AP2Q9UKL3 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CASP8AP2Q9UKL3 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CASP8AP2Q9UKL3 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CASP8AP2Q9UKL3 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CASP8AP2Q9UKL3 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CASP8AP2Q9UKL3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CASP8AP2Q9UKL3 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CASP8AP2Q9UKL3 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CASP8AP2Q9UKL3 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CASP8AP2Q9UKL3 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CASP8AP2Q9UKL3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CASP8AP2Q9UKL3 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CASP8AP2Q9UKL3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CASP8AP2Q9UKL3 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CASP8AP2Q9UKL3 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CASP8AP2Q9UKL3 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CASP8AP2Q9UKL3 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CASP8AP2Q9UKL3 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CASP8AP2Q9UKL3 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CASP8AP2Q9UKL3 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CASP8AP2Q9UKL3 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CASP8AP2Q9UKL3 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CASP8AP2Q9UKL3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CASP8AP2Q9UKL3 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CASP8AP2Q9UKL3 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CASP8AP2Q9UKL3 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CASP8AP2Q9UKL3 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CASP8AP2Q9UKL3 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CASP8AP2Q9UKL3 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CASP8AP2Q9UKL3 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CASP8AP2Q9UKL3 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CASP8AP2Q9UKL3 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CASP8AP2Q9UKL3 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CASP8AP2Q9UKL3 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CASP8AP2Q9UKL3 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CASP8AP2Q9UKL3 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CASP8AP2Q9UKL3 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CASP8AP2Q9UKL3 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CASP8AP2Q9UKL3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CASP8AP2Q9UKL3 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms